Kornberg suchte speziell nach einem physikalischen Chemiker, um die aufstrebende Sparte abzurunden. Er fragte Baldwin, ob er als außerordentlicher Professor für Biochemie in Betracht gezogen werden möchte. Baldwin sagte ja und begann seine Amtszeit in Stanford im Jahr 1959.
Nachdem Baldwin zwischen 1963 und 1964 ein Jahr am Max-Planck-Institut in Göttingen und am Pasteur-Institut in Paris verbracht hatte, wurde er 1964 zum ordentlichen Professor an der Stanford University befördert.
1965 heiratete er Anne Norris, PhD, als er als Postdoc in Paul Bergs Labor traf, als ein Abteilungssekretär, der Cupid spielte, auf demselben Flug zu einer Konferenz Tickets für einander kaufte. Obwohl Norris im Herbst eine Assistenzprofessur an der Harvard University angeboten wurde, heiratete sie lieber Baldwin und blieb bei ihm in Kalifornien. 1971-72 brachte das Paar seine beiden kleinen Kinder in Baldwins zweiter Amtszeit am Pasteur-Institut nach Paris.
Das Levinthale-Paradoxon
Baldwins bereits ausgeprägte Neugier auf Proteine wurde weiter geweckt, als er 1968 in Stanford einen Gasvortrag des Molekularbiologen Cyrus Levinthal hörte, der dann von Columbia zum MIT wechselte.
Die damals übliche Weisheit, basierend auf wenigen experimentellen Beweisen, war, dass ein Protein sofort gefaltet wird, vorausgesetzt, dass seine optimale Struktur innerhalb eines Augenblicks liegt. Aber wie?
In seiner Rede stellte Levinthal dieses Paradox fest: Wenn die Faltung durch einen zufälligen „Vermutungs“ -Mechanismus erfolgt, bei dem ein moderates Protein von beispielsweise 200 chemischen Einheiten über einen langen Zeitraum jede mögliche Kombination von Bindungen zwischen diesen chemischen Bestandteilen länger versucht als das Leben des Universums brauchen würde, um alle Möglichkeiten zu nutzen. Proteine falten sich jedoch schnell und reproduzierbar zu stabilen, funktionellen Strukturen, oft innerhalb von Millisekunden oder sogar Mikrosekunden.
Im Laufe eines Jahrzehnts verwendete Baldwin eine Reihe cleverer biophysikalischer Techniken, um zu beweisen, dass der Faltungsprozess durch die Bildung kurzlebiger Zwischenstrukturen beschleunigt wurde. Diese wurden als Proteinfaltungszwischenprodukte bekannt.
Es ist beispielsweise bekannt, dass einige Bausteine entlang der Reihe eines in Wasser gelösten Proteins Wasserstoffatome mit der umgebenden Lösung austauschen können. Dieser Austausch verläuft langsamer, wenn sich das Protein in einer gefalteten Struktur befindet, als wenn es sich lediglich um eine ungefaltete lineare Sequenz handelt. Baldwin konnte zeigen, dass der Wasserstoffaustausch in einigen Teilen eines bestimmten gelösten Proteins schneller ist als in anderen – was bedeutet, dass einige, aber nicht alle Teile des Proteins in einem gefalteten Zustand sein müssen. Darüber hinaus zeigte er, dass der Faltungsprozess Stück für Stück fortgesetzt wurde, bis das Protein seine volle Struktur angenommen hatte. Es gab mit anderen Worten Zwischenzustände.
Später identifizierte Baldwin bestimmte Fragmente von Proteinen, die in einer kühlen wässrigen Lösung isoliert wurden, sich in helikalen Strukturen zusammensetzten – und dass diese sogenannten Sekundärstrukturen im Wesentlichen mit denen identisch waren, die die Fragmente bildeten, als sie sich im intakten Protein befanden. gefangen.
„Dies ebnete den Weg für Wissenschaftler, die ersten Schritte der Faltung zu untersuchen, indem sie kleine Fragmente und nicht das gesamte Protein analysieren“, sagte Kim.
Baldwin war von 1989 bis 1994 Vorsitzender der Abteilung für Biochemie. Er ging 1998 in den Ruhestand, machte aber laut Berg bis zu den letzten fünf Jahren seines Lebens theoretische Fortschritte.
Baldwin veröffentlichte fast 200 von Experten begutachtete Zeitschriftenartikel und war Mitglied der Redaktion der Journal of Molecular Biology, Trends in der Biochemie, Biochemie, Proteine und Proteinwissenschaft. Er war Mitglied der National Academy of Sciences und der American Academy of Arts and Sciences sowie Fellow der Biophysical Society. Er erhielt 1992 den Stein and Moore Award der Protein Society und 1995 den Wheland Award in Chemistry.
Neben seiner Frau überleben zwei Söhne, David von Seattle und Eric von Urbana, Illinois; und fünf Enkelkinder.
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